此次美國總統大選，讓各界擔憂保護主義可能乘勢興起，台灣也密切關注美國新總統對TPP的態度。台灣近年來持續遊說TPP各會員國，爭取參與TPP第二輪談判，如果TPP破局或延遲生效，將打亂台灣加入TPP可能性。
台灣經濟研究院景氣預測中心主任孫明德表示，若美國貿易保護主義升溫，以美國為主要出口市場的中國、日本、南韓、台灣，經濟不排除受衝擊。如果台灣無法加入TPP，目前輸往美國的資通訊設備、自行車、汽車零組件等產品，出口都將受影響。
據了解，國安會秘書長吳釗燮等國安高層，近幾個月密集關注美國總統大選情勢，多次開會研析TPP可能進展，目前評估，未來發展應不致於太悲觀。
民進黨國際部主任羅致政表示，美國在亞太的戰略布局，包括軍事、經濟、外交三個支柱，缺一不可；美國若放慢TPP腳步，中國將透過一帶一路、RCEP加快區域整合力道，從美中競逐關係來看，美國未必會讓此事發生。
羅致政指出，國際間的確有股保護主義的氛圍，但他認為，各國只是對貿易自由化推展的速度、幅度有所保留，並沒有興起真正的保護主義、孤立主義。他評估，TPP符合美國利益，「新總統上任後，應該只會微調，不會從此冷凍起來。」
中華經濟研究院董事長胡勝正日前分析，美國「選前要選票、選後要鈔票」，不論誰當選，應該都不致於強力反對TPP。
中華經濟研究院WTO及RTA中心副執行長李淳也說，希拉蕊反對的是歐巴馬政府現在談妥的TPP版本，並非全面反對貿易自由化，選後不排除會出現「髮夾彎」，再把TPP拿出來討論。
政大國際關係研究中心美歐所研究員嚴震生的看法較悲觀，他表示，除非歐巴馬在剩下兩個月的跛鴨任期內，在國會力拚通過TPP，否則寄望新總統在第一屆任期內通過TPP，「幾乎是不可能的」。
嚴震生說，美國重啟TPP，起碼是2020後的事，台灣別再把心思寄託在TPP上！他建議民進黨政府，台灣跟中國大陸的經貿往來，不能現在就丟，就算要推新南向，也至少要等到跟東南亞的經貿往來成熟後，再慢慢轉移重心。
「行政院經貿談判辦公室」總談判代表鄧振中表示，政府仍會持續爭取加入TPP，成為會員。若TPP不幸拖很久，政府必須先幫我國有潛力的產品「找空間」，確保我國資通訊（ICT）、物聯網（IoT）相關產品出口時，不會遭遇任何貿易障礙。
鄧振中指出，如果多邊貿易協定暫不可行，還是可以和個別潛力市場（如東南亞）簽署雙邊協定，拓展經貿交流。
前駐美副代表、中研院歐美研究所研究員裘兆琳也說：「若TPP進度減緩，我們必須採取主動，思考其他『堆積木』的方式，進一步提升台美雙邊經貿關係。」例如台美貿易暨投資架構協定（TIFA）談判，就是實質溝通管道。
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