此次花蓮地震引發日本南部及菲律賓都發布海嘯警報，日本氣象廳稍後也將台灣地震的規模修改為7.7，並研判可能是「逆斷層型」地震，跟日本今年發生的能登半島地震同類型。
日本3日在沖繩縣與那國島觀測到震度4級的地震，隨即向沖繩縣南部沿海地區發布海嘯警報。日本氣象廳指出，有高達3米的海嘯預計在當地時間上午10點襲擊日本西南海岸大片地區，沖繩島、宮古島和八重山島居民被通知遠離沿海地區。
日本氣象廳也觀測到，在當地時間上午9點18分，第一波30公分的海嘯已抵達與那國島。石垣島和宮古島也觀測到海嘯。之後因為未發現地震搖晃和海嘯造成的損失而將海嘯警報，調降為「海嘯注意報」。
菲律賓地震局向沿海多個區域的居民發出警告，美國太平洋海嘯警報中心（Pacific Tsunami Warning Center）則在稍後表示，台灣地震帶來的海嘯威脅「目前已經過去」。日媒報導，日本氣象廳3日稍晚對台灣地震，把一開始稱地震規模為7.5、震源深度極淺的數值修改為7.7、深度23公里。
日本氣象廳也表示，花蓮大地震研判屬於「逆斷層型」地震，由於台灣地處歐亞大陸板塊與菲律賓海板塊相交位置關係相當複雜，應可斷定是「海洋板塊所造成的影響」。
逆斷層型地震通常發生在板塊邊緣地帶，在日本、台灣等地周邊，由於板塊推擠，當能量累積到一定的程度時就會發生逆斷層地震，包括今年元旦的能登半島地震都是。
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