在這一波內閣改組爭議中，不論是小幅改組或中幅改組，教育部長曾志朗幾乎都是第一個被點名更換的首長，天天都可以看到執政黨將曾志朗列為第一優先更換對象的消息。
蜜月期才十個月不到
到了三月三日，對於內閣改組將被撤換一事向來對外表達「不以為意」心情的曾志朗，在媒體的追問下也忍不住動怒了，一句「我的理念到底和誰不合？」道盡他這段時間以來的所有心情感受。
回首去年新政府組閣時，曾志朗可是在新任總統陳水扁表示「願意十顧茅廬」的誠意感召下才答應出任教育部長職務。當初再三對外表示沒有意願接掌教育部、放不下學術研究與陽明大學學生的曾志朗曾經表示，新政府在他未點頭前對外公布他將接任教育部長，而陳水扁到陽明大學隔壁的榮總探望唐飛卻未拜訪他，讓他覺得不被尊重；消息傳出後，陳水扁一句「願意十顧茅廬」並親訪後，隔天，曾志朗就舉行記者會表示願意接掌教育部。
在此之前，曾志朗還是陳水扁當選後公布的國政顧問團成員之一，受執政黨、甚至陳水扁重視的程度可見一斑。如今一年不到，新政府內閣改組名單中，曾志朗卻總是「名列第一」，理由是「配合度不夠」。今昔對照，也難怪曾志朗要發出「我的理念到底和誰不合？」的天問。
不過雖然曾志朗和執政黨的關係快速惡化，但和在野黨立委的關係，卻在這近十個月來急速加溫，在野聯盟立委甚至召開聯合記者會集體「挺」曾志朗。
政治學習能力與運作手腕沒那麼差
曾志朗去年五月二十日就任教育部長前一天，在台北市一所小學的演講中一句「立委拿回扣」，慘遭修理，對這位新科教育部長進行一場「震撼教育」，也使得曾志朗第一次到立法院教育委員會進行施政報告就慘遭流會的命運。
不過誰都沒有想到，當時修理曾志朗的立委，今天卻反過來成為支持他的最大一股政治力量，但也有不少支持曾志朗的人擔心，在野立委的強力支持，可能會造成反效果，讓民進黨人士對曾志朗更加反感。
當初陳水扁三顧茅廬請出曾志朗擔任教育部長，包括曾志朗在內大概也沒想到，今天挺他的會變成是當初杯葛他的立委。這也顯示，學者出身的曾志朗，政治學習能力與政治運作手腕其實沒有外界所想的那麼差。
從「十顧茅廬」到優先撤換，短短十個月，曾志朗為何會和執政黨漸行漸遠？又為何會和在野聯盟日漸交心呢？
根據最近一項民意調查結果，曾志朗在「表現較好」閣員名單中，以高達六○％的支持度名列榜首。一般學校對這位不時會從口袋掏出手帕演布袋戲、表演口技、為小朋友講故事的教育部長，評價不惡。
中文譯音之爭與民進黨漸行漸遠
教育部今年有國中學生基本學力測驗、高中多元入學方案、國中小學九年一貫課程等重大教改工程將開始推動，面對來自基層教育單位與人員「推不動」的阻力，以及各界要求延緩實施這些教改方案的建議，曾志朗是吃了秤鉈鐵了心，一定要做。
除了每周開會邀集縣市教育局與學校校長討論外，並密集地展開「全台走透透」，親赴每一縣市了解當地這些重大教改計畫的籌備、推動近況。
就這一點而言，如果沒有足夠的魄力，教改工程推動勢必會步上公共工程施工時間一拖再拖、完工時間表一延再延的後塵。也正因為這些攸關我國國力未來發展的教改工程推動在即，如果在此時更換掌舵者，勢必會為這些教改工作帶來負面影響，引來在野立委的力挺。
中文譯音的拼音系統之爭，是曾志朗與執政黨關係漸行漸遠的關鍵之一。
曾志朗主張採行的漢語拼音系統與執政黨要求採行的通用拼音，差異其實不大，站在國際接軌等專業因素考量下，多數學者其實都贊成採用漢語拼音，而且漢語拼音與通用拼音兩者並不是完全沒有妥協的空間。
教育掃黑掃到有心人
不過中文拼音系統就和核四問題一樣，一旦滲入政治因素，專業考量就再也不是問題的重點。但是不可諱言的是，曾志朗講話經常「凸槌」，也是導致他和執政黨因為拼音系統之爭搞得關係惡劣的原因之一。
至於災區校園重建進度落後問題，雖然為執政黨帶來相當大的政治壓力，不過教育部內部人士都清楚，直接負責督導校園重建的是民進黨籍的教育部政務次長范巽綠，以此一問題做為要求曾志朗負責下台的理由，稍嫌牽強，而且如果真要因此事議處相關官員，范巽綠恐怕也跑不掉。
另外，曾志朗與范巽綠連手整頓私校、配合檢調單位正進行一波大規模的「教育掃黑」，可能牽連到相當多教育官員，層級並有向上發展趨勢，因此教育部內有不少人希望曾志朗去職，讓這波教育掃黑辦不下去，這股力量與有心藉私校辦學牟利的私校董事會結合，據傳也在執政黨方面極盡所能地對曾志朗「下毒藥」，希望去之而後快。
不過儘管這股要求撤換曾志朗的力量不小，但學者出身的曾志朗就任以來的社會形象不差，加上曾志朗當初出任教育部長是中央研究院長李遠哲推薦，曾志朗與李遠哲之間有一定程度的交情，在陳水扁對李遠哲仍有幾分敬畏的情況下，民進黨就算對曾志朗不滿，也只能「忍耐再忍耐」。
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