就在國民黨副主席王金平以及一些本土派立委再次提出「尊李」路線不久，公開談話一向不溫不火、甚至被認為缺乏個性的黨主席連戰，卻在訪問美國期間幾度公然批李登輝，先是聲稱除非對方道歉，否則他絕對不能原諒在上次總統大選攻擊他「聯共反台」的人；稍後又說，對國民黨而言，李登輝已經是過去式了。
熟悉政壇高層動向的重量級人士透露，在接連發生開放八吋晶圓廠去大陸投資設廠，以及國安局「奉天」、「當陽」專案祕密基金曝光兩項重大事件後，陳水扁與李登輝之間過去一直受到小心呵護的關係，的確出現不尋常的裂痕。
扁李不再是長幼尊卑模式 朝相互需要的對等關係微調
特別是在國安局祕密基金事件爆發之後，一位與李登輝經常保持密切接觸的人士指出，阿扁與李登輝在幾次未公開談話中的表現，已經讓李覺得「怪怪的」，兩人不再是過去那種長幼尊卑的模式，而朝著相互「需要」的對等關係發展。而台聯方面也察覺這一氣氛，部分立委曾討論未來的因應之道。
就是在這樣的政治氛圍裡，王金平才在與連戰會面的時候，談起國民黨應該重新思考與李登輝的關係，將李登輝對國民黨的負面影響變為正面或至少保持中性，避免讓李在今後重要選舉中，又成了綠軍獨門武器。
據指出，在那次也有蕭萬長在場的連、王、蕭三人密談過程中，王金平並沒有使用所謂「尊李」這類字眼，只是單純提到目前是可以改善國民黨與李互動的適當時機，而且這麼做對國民黨及連戰個人都有利。
蕭萬長對此議也持肯定看法，連戰則說他個人對李登輝本來就很尊重，連戰與王金平、蕭萬長的那次談話雖然沒有具體結論，可是三人都認為氣氛不錯，也都不排斥與李登輝建立正面互動。問題是次日三人會談消息曝光，而且傳出國民黨將採取「尊李」政策，此說一出，隨即引來黨內反李勢力強烈反彈。
由於連戰對三人會談內容外洩很不高興，而且黨內又有人懷疑，與李登輝一直都有往來的王金平，是基於特殊政治動機，才會向連戰提出上述建議，並迫不及待向外洩漏，致使王金平對國民黨的忠誠再遭質疑，國民黨隨後立刻否認將採取「尊李」路線，黨內批李言論亦順勢升高，情況完全與預期方向反其道而行。
接近王的立法院高層指出，事情演變到這種地步，本來是一片好意的王金平落得裡外不是人，不但國民黨不滿，扁政府認為他陰謀分化泛綠軍，李登輝方面也覺得他多事。該名具有王金平政治智囊地位的立院人士形容，王簡直變成了「豬頭」、「二百五」，以後再也不會輕易充當和事老了。
連戰、王金平互信基礎薄弱
據了解，連戰雖然是國民黨黨魁，可是連既沒有積極進取的戰鬥意志，又無公職及分配資源的權力，且缺乏群眾魅力與民意基礎，在國民黨內只能算是各方現階段都可以接受的「共主」，而不是具有一呼百諾實力的領袖，處境艱難而且欠缺安全感，對於王金平這種雖為黨的副主席，但身為國會領袖又同時與李登輝、陳水扁維持不錯關係的黨內實力派山頭，很自然就會心存疑慮，互信基礎薄弱，互動起來總是疙疙瘩瘩。
尤其儘管國民黨在立法院長那一戰全力為王護盤，可是又在王事先不知情的情形下，拱出江丙坤選上副院長，箇中亦敵亦友微妙至極。
國民黨現在共有五位副主席，連戰除了與王金平之間有信任不足問題外，與蕭萬長、吳伯雄的關係也只能夠以冷淡二字形容，與蔣仲苓、林澄枝之間雖無矛盾可言，但因為這兩名副主席的象徵性遠超過功能意義，在政壇上並未受到注意，也不會有多少影響力。
蕭萬長身為國民黨首席副主席，連蕭關係的不睦卻是政界眾所周知的。連蕭之間本來也無交情，上次總統大選之所以會成為搭檔，並非兩情相悅，而是被李登輝「送作堆」，加以蕭萬長曾經是扁政府規畫國家安定聯盟時，鎖定要拉攏的頭號國民黨高層，由於蕭當時的表現被國民黨認為明顯有投奔敵營的企圖，因此國民黨一方面提高同樣具有財經背景的江丙坤在黨內的地位，同時也幾乎將蕭排除在決策圈以外，目前蕭已漸漸淡出現實政治運作。
蕭萬長淡出現實政治運作 吳伯雄已是宗教界人物
據指出，蕭萬長對於政治已是心灰意冷，尤其不久前一本以蘇志誠為主角的新書，又扯出蘇曾經擬定倒連Ａ計畫，蕭則是一顆被用來倒連但用後即丟的棋子，再次驗證蕭萬長始終是朝野鬥爭工具，令蕭唏噓不已。
另一位國民黨副主席吳伯雄也同樣身處高層冷凍櫃中。吳在政壇出道極早，歷任國民黨執政時代黨政要職，二○○○年總統大選期間，他的政治動向不明，遊走於國民黨與宋楚瑜間，最後雖選擇國民黨這一方，可是仍然既開罪了宋楚瑜，又未能獲得連戰陣營信任，只好把大部分力氣投注在經營佛光山台北道場，伴隨星雲法師的時間遠多過他在國民黨中央黨部的時間，無怪國民黨人士戲稱吳伯雄現在已是宗教界而非政壇人物。
連戰與幾位副主席的關係，反映了國民黨當下危險的局勢，主事者沒有旺盛的企圖與意志，理應輔佐者又個個疏離，全黨都知道處境艱危，必須有非常作為，但是人人束手無策，坐觀客觀形勢越來越不利，上下暮氣沉沉，瀰漫衰敗之氣，有人還在作重掌政權的春秋大夢，有人等著混到國民黨瓦解到無法再混下去的那一天，但是前者已經越來越少，後者卻越來越多。
