被動效率差的基層公務員、沒有實權的二級長官，加上好大喜功的前署長，國家機器因而運轉不良，難怪SARS一疫，政府的防疫大軍被一舉擊潰，戰敗的兩名大將只得陣前落跑。
五月二十日，新任的疾管局局長蘇益仁在廳內召開例行記者會，他明快地宣布了幾項 SARS 疫情管控的最新措施，然而他的新部屬此時卻正在廳外跟其柋單位的官員大吐苦水，抱怨他的種種作為和要求，這樣的不滿，可能是蘇益仁始料未及、且永遠無法親耳聽到的。
這場「官員群聚抱怨」的內容如下：「二十日說要資料，幾個人一起做，二十二日也做不出來，上面規定我們二十一日交，根本不可能。」「我請他戴上口罩，他竟然對說我不要干涉他的隱私權！」「這些人都是學者出身，是諮詢的對象，不適合待在行政體系。」
SARS肆虐 疾管局官僚依舊
其實，跟基層行政人員的互動不良，並不是單單只有像蘇益仁這樣的新官，同時也發生在中華民國許多不擅官場應酬的官員身上。
基層行政人員良莠不齊，陽奉陰違的也許只是其中的少部分，然而太平官當久了，缺乏警覺心也是不爭的事實。在 SARS 風暴下，行政基層卻宛如身在暴風眼，仍舊按照平常的節奏在辦公，渾然忘記緊急情況下應有的效率。
蘇益仁接任之前，消費者文教基金會開始憂心台大、台北馬偕、桃園敏盛及高雄長庚等醫院，接二連三宣布急診部暫停服務之後，消費者萬一發生車禍或急性盲腸炎等緊急狀況應該如何就醫？當消基會拿這個問題詢問衛生署、疾管局等單位，得到的回應竟是「醫院不必向該等單位報備，因此，請消費者看電視就好了！」
消基會質疑，衛生署老早就已經正式成立全國 SARS 防治指揮中心，理應全面統籌與強化防疫的重點工作，但在各大醫院連續爆發群聚感染或疑似院內感染之後，政府單位的回應卻是如此「平常」，令人憂心所謂整合與強化工作的品質在哪裡？
涂醒哲出身疾管局 擅長衛教行銷
身為全國最高防疫指揮總部的疾管局，現有七百八十名員工，下設九大組、六大分局、血清疫苗研究中心， 還有一座符合 GMP 的人工疫苗工廠，而且成立不到四年，是衛生署底下相當年輕的單位。
一九九九年七月，行政院合併了原衛生署防疫處、預防醫學研究所及檢疫總所三個單位，成立疾管局，主掌各種疫病之預防、控制、調查及研究事項，其第一任局長就是剛下台的衛生署署長涂醒哲。
涂醒哲時代的疾管局，極為擅長衛教行銷，為了宣導傳染病防治，曾經設計了保險套主題餐廳、衛教代言人「急管吉」、防疫漫畫「終極鼠探」……。在主任祕書施文儀獻策之下，又接連推出「打電動防腸病毒」、西洋情人節有氧抗愛滋、學童病媒昆蟲營等活動，一連串防疫衛教的強力傳播，令人目不暇給。
然而，一面對 SARS 鋪天蓋地而來的挑戰，這位留美流行病學博士學歷的前防疫首長，卻顯得手忙腳亂、缺乏魄力，就連最拿手的衛教宣導，也因製作「其實SARS 遠比匪諜少」的防治宣傳——自以為幽默卻不當的比喻， 引起朝野群起攻之。
GIS疫情地理資訊 只是門面
看到政府之前的抗煞作為，花蓮慈濟副院長王立信不禁嘆氣連連。「政府在初期太樂觀了，還一直散布『天氣熱疫情就會降溫』之類沒有根據的消息。王立信接著又說：「疾管局從來沒有提供醫療院所完整的問診單，導致許多醫師不知如何正確診斷 SARS。」
那麼，衛生署和疾管局是否有把防疫工作做好？王立信認為，從結果來看，答案是否定的。
另外，學者也很懷疑疾管局購置的防疫設備是否健全。以疾管局相當自豪的 GIS疫情地理資訊查詢系統為例，一位台大醫學院公衛教授指出：「國外建構完善的GIS 系統除了標示疫病所在區域，應該也要一併顯示大型醫院所在地、醫院附近的人口密度，以利民眾就診或是隔離病床的調度，若是考慮到封區，甚至連消防隊的位置都要標出來。」
類似的失誤不勝枚舉，台大醫院也曾指責疾管局接到該院的求援電話，卻遲遲沒有做轉診的處理，導致台大醫院急診部因塞滿了疑似病例而「淪陷」，終得宣布半封院。
前局長滿腹委屈 自稱專業不受尊重
面對各界批評，前疾管局局長陳再晉也是滿腹委屈，他在公開場合不只一次怨嘆專業不受尊重，他的防治意見不僅在體制內不被接受，媒體也不曾報導，種種的失望，煎熬著他的心。
「SARS 做不好，都是疾管局的錯，若是做得好，早被別人搶走功勞。不過沒關係，我是當成在做功德。」陳再晉說。
針對以上許多批評，陳再晉的回答是：「病床數在網路上都有公布，台大醫院張上淳沒有上網查」、 「GIS 系統有發揮功能」、「局裡不可能有人會說『請消費者自己看電視』的話」、「通報表上有臨床症狀的描述，填清楚就好了。」
不過，如果實際上疾管局的網站，會發現的確有登錄隔離病床的數目，但卻是總數，各大醫學中心和各地區醫院的所剩床數則闕如，對於有轉診需要的醫院和診所，並不知道哪裡還有隔離病床。再者，GIS 系統上所編列提供查詢的傳染病，也並沒有將 SARS 列入，更別提各醫院的地理位置了。
不知陳再晉所稱的專業不受尊重，從何而來？如果對自己的工作內容都沒掌握，又如何能期望別人能夠給與尊重呢？
被動效率差的基層公務員、沒有實權的二級長官，加上好大喜功的前署長，國家機器運轉不良，難怪 SARS 一疫，政府的防疫軍隊被擊潰，戰敗的兩名大將只得陣前落荒而逃。
