教育部受到物價飆漲、民進黨立委要求凍漲的雙重壓力下，九十七學年度大專校院學雜費審議特地搞了一套計算公式，因此比往年晚了兩個月才公布調漲案。結果六十四所大學中，僅八分之一的八所私立大學獲准漲價，公立大學全數凍漲。
扮演關鍵角色的教育部長鄭瑞城，先是煞有介事的搞公式，卻在記者會一小時前才發簡訊通知媒體，自己又未親上火線，而是由政務次長呂木琳宣布結果──「嚴格審查、共體時艱」。
由於教育部六月底就收到各大學送來的調漲案，對外保密到家，鄭瑞城卻私下要求高教司打電話去勸退某幾所國立大學。
為了反映成本，許多大學都有意調漲學費，為了究竟要不要漲、該漲多少，還編了一堆數字資料，做成調漲案送進教育部，結果教育部卻不敵四面八方的壓力。清大教務長王天戈便直批：「教育部不敢漲，就別找藉口。」根本讓學校「瞎忙」；陽明大學校長吳妍華說：「漲這麼少還來勸退。」政大雖未同意勸退，但還是被凍漲。私立技專協進會理事長、輔英科技大學校長張一蕃也批評：教育部六月才研擬出一套公式，還要大學背書。
表面上說完全依照程序，鄭瑞城卻相當懂得為官的私下運作之道，只是勸退了半天，顯然仍是讓諸多校長們覺得被擺了一道。
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