交大校長續任風波不斷，在投票之前，出現校友總會理事長宣明智、選舉事務委員會召集人邱羅火，以及群聯電子董事長潘健成等人，紛紛以嚴厲聲明表達對現任校長吳重雨的不認同。這一連串的事件，也讓這所國內電子業校友勢力最龐大的學校，蒙上一層陰影。
由宣明智、凌陽董事長黃洲杰、緯創董事長林憲銘等重量級交大校友組成的校友會，在日前交大校長續任投票前，共同署名發表一封信，表達非常擔憂最近交大的發展，包括國際排名後退、學術地位下滑、優秀教授流失，以及募款能力較台大、成大、清大明顯落後等。
雖然吳重雨在第一時間針對這些質疑澄清，同時也引述相當多的資料來反駁，但是邱羅火也提出因為對校長續任選舉的各項爭議無法背書，因此選擇退出委員會；此外，潘健成也發表一份聲明，希望校方能夠察納雅言，共同追求交大的進步。
據了解，目前校友會已募集一千萬元作為協助學校進行下一任校長遴選作業之經費，並建議以現任校長及其他具有國際聲望的學者為遴選對象，看來，未來交大選校長的風暴，可能還會持續一段時間。
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