國內日前爆發本土案例，染疫者是照顧新冠肺炎患者的醫師與護理師，這起院內感染事件震驚社會，過往對於已知訊息通常會立即發布，不過當天中央流行疫情指揮中心卻沒有任何動作，直到隔天下午才對外證實，引發外界質疑不早點公布的原因；對此，今（14）日早上指揮官陳時中說明當時的緊急作業流程，更指出「當晚全院的人都沒睡覺，緊急召回關係接觸者採檢。」
日期：2021-01-14
中央流行疫情指揮中心昨（12）日證實，國內新增2例本土案例，染疫者為北部醫院的醫師與護理師，這也成為台灣第一例醫師確診個案，震驚社會。對此，前衛生署長楊志良不滿譴責，就是因為醫師沒有落實防疫SOP，自覺沒事才會導致後續需要框列多人，醫院應該要處分這位醫師，甚至把他開除！一席話令臨床醫師吳欣岱火大反駁，「請沒有插管過的人不要再不懂裝懂了！」
日期：2021-01-13
台灣本土案例連續好幾日都破千，對於兒童疫苗何時會開放，不少家長都很關心。對此，中央流行疫情指揮中心於4/17宣布，6至11歲兒童開放可以施打「半劑量」莫德納，第二劑則於第一劑施打後28天後可追加。許多家長卻又擔憂，認為BNT目前的國際數據相較於莫德納較多，對於半劑莫德納還是有疑慮。台北市長柯文哲周一(4/18)則表示，「如果沒有BNT只有莫德納還是可以打，若是利大於弊的情況下，該打就打。」
日期：2022-04-19
中央流行疫情指揮中心今（24）日公布，本土案例新增六人死亡，是連續兩天新增六個死亡案例。指揮中心說明，這波疫情從5月14日之後通報的死亡個案共有17例，其中慢性病14例、無慢性病2例、不詳1例。若觀察這23個案例的背景，可以看出最大共通處，就是大多數是60歲以上的中高年齡民眾，而且幾乎都有慢性病史，從高血壓、糖尿病、心血管、心臟病到B型肝炎不一而足，特別是高血壓。
日期：2021-05-24
華航機師、防疫旅館諾富特的群聚感染，今（3）日再增兩例本土案例，群聚累計達26人染疫，其中案1145為諾富特飯店外包商的工作人員。然而，案1145一開始並未被中央疫情指揮中心匡列隔離，從出現症狀到通報確診，至少有三天在社區裡自由行動，足跡仍待調查，引起社會恐慌。此次防疫旅館成為破口，外界才驚覺防疫旅館的內控竟然如此寬鬆，也意外燒出台灣防疫的多項管理黑洞。
日期：2021-05-03
華航染疫事件持續擴大，接待機組人員檢疫的諾富特飯店已有4名員工確診，昨（4/30）已被指揮中心定調為「飯店群聚」，今（1）日除了當初一名確診的機師的同住家人也確診，讓本土案例再添1件外，又傳出載運員工的遊覽車司機有發燒症狀，對此，衛生局表示，當天飯店員工、機組員都穿隔離衣，應不至於傳染給司機，而指揮官陳時中則表示，該名司機已送醫採檢，而採檢結果為陰性。
日期：2021-05-01
台灣COVID-19（武漢肺炎）今（19）日再新增4例本土案例，桃園群聚感染疫情似乎越演越烈，中央流行疫情指揮官陳時中坦言「確診案例確實比想像的多」，宣布今起開始清空醫院並全面消毒，而其中案865為一名在桃捷A7（體育大學站）摩斯漢堡店上班的20多歲女性員工，目前有與該員工接觸的店長也正在居家隔離，由於桃捷A7摩斯漢堡店接觸範圍甚廣、桃捷往來人數多，因此匡列範圍恐再擴大。
日期：2021-01-19
自去年12月22日出現1本土案例後，台灣疫情再度出現紅色警示，加上全球疫情不斷升溫，指揮中心不得不繃緊神經宣布，自1月15日起，所有入境者都需於登機前檢附檢疫居所證明，以集中檢疫及防疫旅館為主，居家檢疫則須1人1戶且填寫切結書，強化防疫措施。針對此政策，資深藝人黃安感到不以為然，先是更大讚中國防疫是「世界第一」，再痛批台灣是「笨蛋草包政府」，一旦做錯就賴給大陸。
日期：2021-01-07
中央疫情指揮中心28日公布的本土案例中，其中案269，觀光局已證實是派駐桃園機場的員工，因「接待」觀光局主任秘書兒子（案277）從菲律賓歸國，還在機場裡面喝咖啡，因此感染COVID-19（武漢肺炎），結果連案269的5歲小孩也確診。對此，知名電視節目主持人趙少康在網路直播節目中表示，現在觀光客、外國人都不能來台了，觀光局會不知道嗎？主秘卻完全沒有防疫意識，「沒有什麼好接的嘛，你兒子那麼寶貝？」
日期：2020-03-31
平鎮某醫院30日出現本土案例，為部立桃園醫院確診病患至該院就醫時，待在同一候診區的陌生陪病男子。由於該男子是在1月23日接觸確診者，1月26日被匡列居家隔離，因此有3天的時間在外活動。專家表示，新冠肺炎的潛伏期最短2天，快的話25日就有傳染力，指揮中心掌握足跡後，應告知大眾。另該專家也認為，此案並不屬於院內感染，而應要稱為社區感染。對於整起桃醫群聚，必須要觀察到2月9日才能安心。
日期：2021-01-31
