本土疫情一波未平一波再起，自5月11日至今日，將近一個月的時間，累計確診者達10215人，有274人死亡，當中有不少從發病到死亡僅2、3天內的案例出現。而在公布國內新增36人的死亡人數中，有13人是死後才確診染疫的，對此外界質疑是否有更多黑數存在？對此指揮中心也回應了。
日期：2021-06-07
中央流行疫情指揮中心今(5)日公布國內新增8例COVID-19(武漢肺炎)病例，均為境外移入，為4男4女，年齡30多歲至60多歲，入境日介於3月14日至4月2日，發病日介於3月18日至28日。新增個案中，1人為本土個案同住家人，1人與摩洛哥旅遊團群聚相關，3人與奧捷旅遊團群聚相關。
日期：2020-04-05
中央流行疫情指揮中心今日公布國內新增16例新冠肺炎病例，包括2例本土及14例境外移入。本土個案中，連指揮中心指揮官陳時中都坦言發病久，較憂心個案是一名50多歲男性(案268)，無出國史，早在2月28日出現症狀，但去3次去診所都被認為是感冒，確診前6次就醫才通報。
日期：2020-03-28
高雄確診男台商因隱匿發病期間活動史，加上在沒有配戴口罩的情況下，前往舞廳消費導致坐檯的人員傳出呼吸不順等症狀，高雄市長韓國瑜昨（25）日晚間宣布立即坐鎮高雄指揮防疫，並將防疫級數提升至一級開設；然而現在疫情除了高雄，澎湖也傳出疑似感染武漢肺炎的病例。
日期：2020-01-26
今年十一歲的小可，五歲以前因為氣喘病，住了五十四次醫院，小可的病情不僅影響家庭生活的作息，還導致父母親離婚。氣喘病不時的發作，小可無法正常上課，老師與同學害怕一不小心會刺激他發病而遠離他，老師不要他上體育課，沒有玩伴、功課又跟不上，小可不願意上學，甚至開始逃學……
日期：1999-05-20
指揮中心今（5）日公布，新增17例死亡個案，為14位男性、3位女性，發病日介於5月16日至7月2日，確診日介於5月19日至7月5日，死亡日介於6月28日至7月5日。醫療應變組副組長羅一鈞，今天特別就其中的三位提出說明，年紀都只有40多歲的年輕人，當中更有一位沒有先天的慢性疾病。
日期：2021-07-06
百萬YouTuber莫彩曦與老公Adam，夫妻倆一口流利中文介紹台灣與美國文化，深受許多民眾喜愛，不過15日發佈影片卻透露元旦時老公Adam確診新冠肺炎（COVID-19），接著自己也跟著確診，並拍下影片記錄發病到痊癒的所有過程。不少粉絲得知消息，湧入各大社群平台表達關心和祝福，讓夫妻倆深夜感性發文：「謝謝你們一直對我們這麼好。」
日期：2022-01-16
國內8日爆出一名浙江台商返台，雖然當時持有COVID-19（武漢肺炎）陰性證明，沒想到在居家檢疫第12天時確診，該名台商的感染源是本土還是境外，指揮中心表示仍待確認；但台大兒童醫院院長、感染科權威黃立民認為，過去97.5%確診案例都是在感染11天內發病，因此推斷本土感染的可能性高，且破口有可能就是防疫旅館！
日期：2020-12-09
國內首度爆發「牛結節疹」疫情，農委會防檢局表示，該例發生在金門畜試所，場內共飼養548頭牛，其中23頭發病已撲殺，其餘牛隻基於防疫考量，也將全數撲殺。即日起禁止金門生鮮及冷藏牛肉賣到台灣本島，牛肉乾因經高溫殺菌製作，則不在限制範圍內。因是蟲媒直接叮咬傳播，兩岸往來船舶、飛機，須做好殺滅蚊蟲消毒。
日期：2020-07-11
中央流行疫情指揮中心今(26)日公布國內新增17例COVID-19(武漢肺炎)病例，包括15例境外移入、2例本土。本土病例(案246、247)均為境外移入個案的接觸者，其中案246為60多歲男性，為案209(美國移入)同住家人，無疑似症狀，經接觸者採檢後確診；案247為40多歲女性，為案228(荷蘭移入)同住家人，於3月23日發病，經就醫採檢通報後確診。
日期：2020-03-26
