指揮官陳時中緊急宣布，整個部桃皆屬於「紅區」，預估會有5000人需要居家隔離。對此，宅神朱學恒於臉書上，批評中央防疫，只會口頭上挺醫護，沒有實質上的作為，不鎖國一直讓外國人進來，不斷增加境外移入；醫護害怕自己染疫，想要篩檢還需要有症狀，沒有則要自己出錢。朱學恒希望政府正視第一線的醫療人員，將資源真正的分配下去，不要感覺上只是「口頭上的挺」。
日期：2021-01-25
台北市前衛生局長邱淑媞近日不斷批評指揮中心防疫措施，先是指防疫政策嚴重欠缺邏輯，才造成部桃醫院感染擴大，面對網友提及當年SARS更回應「民進黨放香港病毒進台灣，害死和平醫護」等言論，激烈發言引發社會大眾不滿。對此，有粉專怒披露一封當年抗SARS殉職護理長家屬的血淚示警信，不僅控訴當年的慘況，也希望台灣人不要遺忘，呼籲「歷史的教訓一次就夠」。
日期：2021-01-25
衛福部桃園醫院爆發群聚感染，昨（22）日再爆2名本土案例，至今已12人染疫，案881更是本案「首位住院病患」。前台北市衛生局長、SARS期間「和平封院」決策人之一的邱淑媞，在臉書發文羅列指揮中心的4大錯誤，痛批指揮中心防疫欠缺邏輯，並稱正確作法就是「禁止部桃人員進出」，言論引來各界圍闡：「防疫，其實只是很簡單的邏輯而已，不要相信太空人！」
日期：2021-01-23
中央流行疫情指揮中心今（17）日公布國內新增1例本土COVID-19確定病例(案856)，為本國籍30多歲男性，與案838為同一醫院之醫師，1月10日工作時曾與案838接觸，1月11日採檢結果為陰性，因應案852確診，衛生單位於昨（16）日陸續針對案838、839匡列之265名醫院人員進行二採，其中案856檢出陽性於今日確診；另其餘264人中，224人檢驗陰性，其餘待採檢。
日期：2021-01-17
國內日前爆發本土案例，染疫者是照顧新冠肺炎患者的醫師與護理師，這起院內感染事件震驚社會，過往對於已知訊息通常會立即發布，不過當天中央流行疫情指揮中心卻沒有任何動作，直到隔天下午才對外證實，引發外界質疑不早點公布的原因；對此，今（14）日早上指揮官陳時中說明當時的緊急作業流程，更指出「當晚全院的人都沒睡覺，緊急召回關係接觸者採檢。」
日期：2021-01-14
自去年12月22日出現1本土案例後，台灣疫情再度出現紅色警示，加上全球疫情不斷升溫，指揮中心不得不繃緊神經宣布，自1月15日起，所有入境者都需於登機前檢附檢疫居所證明，以集中檢疫及防疫旅館為主，居家檢疫則須1人1戶且填寫切結書，強化防疫措施。針對此政策，資深藝人黃安感到不以為然，先是更大讚中國防疫是「世界第一」，再痛批台灣是「笨蛋草包政府」，一旦做錯就賴給大陸。
日期：2021-01-07
指揮中心今天宣布台灣出現第一例英國變種病毒病例，陳時中表示，英國回來有發燒的個案，原本就已確診，經過基因比對，正式證實是英國變種病毒。所以這個案例到了台灣，從機上開始有適當防護，到整個檢驗，目前在醫院治療中，有輕微症狀並不嚴重。
日期：2020-12-30
中央流行疫情指揮中心今(28)日公布國內新增8例境外移入COVID-19確定病例(案787至794)，分別自英國、菲律賓及印尼入境。
日期：2020-12-28
中央流行疫情指揮中心今(23)日公布國內新增6例境外移入COVID-19確定病例，分別自菲律賓及印尼入境(各3例)。
日期：2020-12-23
COVID-19疫情持續蔓延，全球確診與死亡人數不斷向上攀升，各國醫療、檢驗與診療體系面臨嚴峻考驗，臺北市政府衛生局於109年11月23日舉辦2020臺北後疫情時代《智慧新生態 健康新時代》論壇，邀請產學研專家從政策面、產業面等角度，探討疫苗、快篩工具與通訊診療議題，呼籲大眾共同面對疫情帶來影響與改變，建立與疫情共存的健康新常態。
日期：2020-12-22
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