中央流行疫情指揮中心今(29)日公布國內新增54例COVID-19確定病例，均為本土個案；另確診個案中新增8例死亡。另外，針對屏東Delta病毒群聚案件，指揮官陳時中指出，枋寮果農（案14734）的基因定序提前出爐，確定感染了Delta變異病毒株！而該名患者的妻子（案14816）也染疫，不過目前基因定序結果尚未出爐。
日期：2021-06-29
中央流行疫情指揮中心今（28）日公布國內新增60例COVID-19確定病例，均為本土個案；另確診個案中新增3例死亡。
日期：2021-06-28
屏東祖孫自秘魯回國感染Delta病毒，截至昨（26）日共造成12人的群聚感染，當中指揮中心公布包含秘魯祖孫總計6人確認「感染的是Delta病毒」，另外4起，分別是白牌車司機，及司機乘客與其同住者祖孫。今（27）日疫情記者會上公布部分基因定序個案結果，再新增2人驗出Delta病毒株，目前確認共8位；雖然結果還未全數完成，但指揮官陳時中口頭表示，「群聚12人中，有驗出來的都屬於Delta病毒株。」可見傳染力相當的驚人！
日期：2021-06-27
中央流行疫情指揮中心今(26)日公布國內新增78例為本土個案，死亡案例則有13例。由於屏東自秘魯返台祖孫確診感染印度Delta病毒，加上後續接觸者有12人群聚事件，今日病毒基因定序結果出爐，其中6例經基因定序後，均為Delta印度變異株。
日期：2021-06-26
中央流行疫情指揮中心今(15)日公布，國內新增135例COVID-19確定病例，其中132例為本土個案，另有3例境外移入；確診個案中新增8例死亡。
日期：2021-06-15
中央流行疫情指揮中心今（14）日公布國內新增185例COVID-19確定病例，均為本土個案；另確診個案中新增15例死亡。
日期：2021-06-14
全台疫情嚴峻，現在連百貨業可能都有陷入群聚染疫的危機！台北新光三越站前店一名櫃姊被同事爆料，身體微恙還上班，甚至隱匿家人確診的消息，如今已有3名櫃姊確診，無獨有偶地，台中中港店也傳出1名櫃姊確診，今（11）日休館一天緊急清消。
日期：2021-06-11
國內武漢肺炎（新型冠狀病毒病，COVID-19）疫情嚴峻，又爆發院內群聚感染事件，新北市三峽區恩主公醫院傳出群聚感染，包括病患、看護、護理人員、照服員等7人確診，其中1名男病患確診當日死亡，新北市衛生局已證實，目前已匡列71名醫護、病人隔離，詳情將由醫院說明。
日期：2021-06-10
指揮中心將篩檢視為對抗疫情的主要武器，最精準的PCR檢測就是不可或缺的彈藥。能否提升檢測量能，讓高風險社區同步執行快篩與PCR，並縮短等待時間，是抗疫成敗關鍵。
日期：2021-06-09
中央流行疫情指揮中心今（8）日公布國內新增219例COVID-19確定病例，均為本土個案。確診個案中新增22例死亡。
日期：2021-06-08
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