新舊課綱爭議延燒，教育部與高中學生對話始終無交集，新舊課綱並行已如期在八月一日上路，《今周刊》特地比對各家書商新舊版本的歷史與公民教科書，若政策未改，依據微調課綱編訂的新版教科書，確實改很大。
教育部最早於六月一日宣布新舊課綱並行，事實上，各高中早在五月就收到教科書樣書，因此新版教科書是依據微調後的課綱（新課綱）編訂，舊版教科書才是依據一○一課綱（舊課綱）編訂，各高中六月就選書完成。
目前全台灣五○六所公私立高中，屬於教育部國教署主管的有三一三所，四大教科書商之一的南一書局透露，以南一教科書而言，各高中新舊版本選書比例約七比三；另據透露，其他三家也差不多如此，主要是因六月選書時，教科書商都是拿新版本給學校老師選。
新舊課綱並行 但明星學校多選舊版本
《今周刊》進一步詢問全台十二家明星高中，今年高一歷史教科書新舊版本選用結果，使用新版的學校只有師大附中、中山女中二所。其他如北一女中、建國中學、武陵高中、台中一中、台南一中、高雄中學、台南女中七所高中都用舊版。成功高中、高雄女中和景美女中已選定書商，但要用新版或舊版則尚未定案。
高一公民教科書部分，使用新版包括景美女中、武陵高中、台中一中和台南一中四所；使用舊版的有北一女中、師大附中、中山女中、台南女中、高雄中學五所。建中校長徐建國表示，將繼續沿用全華的版本，新舊版本的選擇交由各科老師自行決定；成功高中和高雄女中則已選定書商，但要用新版或舊版仍未定案。
儘管民進黨包括台南市長賴清德在內的執政縣市長曾發表聲明，鼓勵轄內學校沿用舊課綱，但屬於國立高中的台南一中、台中一中、桃園的武陵高中仍選用新版教科書。
而若是學校選用依據新課綱編訂的新版教科書，學生將看到與舊版差距頗大的內容。
課綱微調爭議最大的台灣歷史，高一上學期就會讀到，一○一高中歷史課綱修訂專案小組召集人、中研院近史所所長黃克武道破新舊版本的差異：「微調課綱是把台灣拉回中國文化圈，而一○一課綱則是盡量使用中性字眼描述台灣歷史，不給予價值判斷。」
主導課綱微調的教育部課綱檢核小組認為，整體更動的理由是依據《憲法》，但政大台灣史研究所所長薛化元說，根據《憲法》可以講述憲政，但不可以講述過去的歷史事實；而每一段歷史都要強調中國與台灣的關係很奇怪，原本在歷史課本中就有講到多元文化，其中就包含中國。
《今周刊》實際翻閱市占率較高的南一、翰林、三民和龍騰四家，以及康熹、史記、華興、全華與泰宇共九家出版社的教科書比對發現，新舊版本光是目錄的標題就差很大。
引發爭議的當代臺灣歷史，舊課綱的「從戒嚴到解嚴」單元，微調課綱變成「從光復到政府遷臺」，新版教科書除翰林維持「從戒嚴到解嚴」外，其他全都不再使用「戒嚴」、「威權」等字眼。以南一版為例，原本舊版大標「威權體制走向民主政治」，新版改為「從光復到政府遷臺」；龍騰版原本為「從戒嚴到解嚴」，新版改為「一九七○年代之前的政經外交」。
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拉進中國文化圈 新課綱加入「漢人來臺」
對於這樣的調整，黃克武解讀，這是淡化蔣氏威權體制、戒嚴時期的色彩。
而舊課綱的「日本統治時期」改為「日本殖民統治時期」，南一、翰林、華興新版都加入「殖民」二字；三民與康熹則分別維持舊版「日治臺灣」、「日本統治時期」。
除了近代台灣史大改變以外，依據新課綱，新版各家教科書清一色把「原住民」改為「原住民族」。薛化元說，《憲法》上的原住民族定義不完整，若根據《憲法》規範原住民族，並不切合歷史事實，台灣史將會缺少西拉雅族、凱達格蘭、巴布薩等原住民。
此外，新課綱在「國際競逐時期」主題加上「漢人來臺」，南一、翰林、三民、華興、史記等版本都據此修改。薛化元解釋，舊版「國際競逐時期」內文都有介紹到中國，但現在加入「漢人來臺」，明顯拉近與中國的關係。
新課綱將原本的「荷西治臺」改為「荷西入臺」，南一、翰林、華興直接改或加入「荷西入臺」；三民則用「荷西統治下的臺灣」，史記則是使用荷蘭、西班牙在臺灣的「占領」；康熹則維持原來「占領」用詞。
薛化元分析，荷西「治」臺，是指荷蘭、西班牙統治臺灣，而荷西「入」臺，則不承認中國以外的國家合法統治過台灣。
新課綱將「鄭氏統治時期」改為「明鄭統治時期」，翰林、華興、史記、南一等版本標題都修改為「明鄭」，康熹則維持現有的「鄭氏」，龍騰也維持「鄭氏」，但在內文有說明「明鄭」的由來，三民標題則為「漢人政權建立」，行文使用「鄭氏」。
黃克武說，鄭成功政權應該是介於明鄭與獨立政權之間，使用「鄭氏」比較中性客觀，使用「明鄭」則拉近鄭氏與明朝的關係。薛化元則質疑，鄭氏政權時期大明已經滅亡，哪來的「明鄭」？
除了用詞的更改，部分教科書內文也引發爭議。當代史琢磨最多的史記版本，敘述「……陳水扁總統時期採用『烽火外交』政策，引起中國大陸強烈反彈。」、「……美國宣布中華民國國民赴美免簽證，成為第一二九個給予我國免簽證待遇的國家。證明中華民國雖然只有二十二個邦交國，但追求實質外交的成就，卻能讓台灣成功走向國際。」
新教科書有色彩 稱319案「為民主蒙陰影」
史記版在敘述二○○四年總統大選時也寫：「儘管選舉前一天發生了三一九槍擊事件，為臺灣的民主選舉蒙上一層陰影……」。黃克武認為，近代歷史應避免使用褒貶的字眼，不須有情緒，盡量中性為佳。
從各家新版教科書內容調整可見，課綱用詞的變動，直接影響到教科書內容。事實上，這樣的用詞爭論，馬英九總統上任後進行的一○一課綱審定時就曾發生過，但當時的召集人黃克武認為，歷史用語盡量使用中性字眼，例如接收臺灣、日治等，遣詞用字是所有委員都有共識，達到「微妙平衡」。
翻開一○一課綱研修小組名單，除黃克武外，包括多名重量級歷史學者如中央研究院院士陳永發、中研院近史所研究員林滿紅與台灣大學歷史系教授周婉窈等，而這次微調課綱的檢核小組召集人王曉波當時也參與，做出的結論可說已凝聚各方觀點的「共識」。
然而，課綱檢核小組原本任務為檢視教科書用詞，權責不在修改課綱內容，卻在臨時動議下，把「課綱微調」加入工作內容。而十一人檢核小組中僅兩位歷史學博士，其他如王曉波為世新大學中文系教授、謝大寧是佛光大學中文系教授、朱雲鵬是中央大學經濟系教授等，這樣的組合大幅改寫由二十多位專業歷史學者決議的一○一課綱，過程又未公開透明，難怪許多平常不願上媒體的歷史學者都站出來反對。
公民課本不提美麗島 怎交代陳水扁、蘇貞昌崛起？
除了歷史之外，「公民與社會」微調課綱爭議也很大。調整幅度最大包括，在人權章節的說明刪除白色恐怖、良心犯片段，理由為白色恐怖在歷史課本中已有詳盡描述，無須重複；另在多元社會章節，增加台灣社會「具有深厚中華文化傳統」的論述。
儘管教育部強調修改課綱的「說明」文字，不具拘束力，但康熹版將台灣白色恐怖時期的描述全數刪除，全華版將「中壢事件」與影響台灣民主至深的「美麗島事件」全數刪除。外界質疑，要如何向學生說明民進黨前主席許信良在台灣的民主地位，和前總統陳水扁，以及曾任行政院長的蘇貞昌、謝長廷等「美麗島辯護律師世代」何以成形？
公民教師行動聯盟成員、台南一中老師郭復齊認為，公民課綱微調刪除以台灣白色恐怖說明人權，修改成殖民地政府濫用權力對殖民地迫害，反而將人權的說明抽象化，「人權教育必須與白色恐怖、小警總、爭取言論自由，這些在台灣真實發生的事情做結合。」
歷史教育最重要的是尊重史實，公民教育重視的也是思辨能力，由於微調課綱內容不夠客觀，也未遵守程序正義，才引發極大爭議。如何讓課綱史觀爭議達到學者所倡議的「微妙平衡」，避免付出更大社會成本，考驗執政者的智慧。
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