這波疫情來得又急又猛，雙北於5月15日升級為三級疫情警戒，5月19日全國統一升級為三級。三級警戒經過二次延長，目前至6月28日，學校則持續停課至暑假，大學指考甚至因此延期。
日期：2021-06-18
中央流行疫情指揮中心今(15)日公布，國內新增135例COVID-19確定病例，其中132例為本土個案，另有3例境外移入；確診個案中新增8例死亡。
日期：2021-06-15
全國在嚴格的三級警戒管制之下，中央流行疫情指揮中心副指揮官陳宗彥指出，雙北疫情有稍微趨緩；不過，端午連假才剛過去，陳宗彥提醒，雙北以外的地區要密切注意疫情發展、變化，嚴守防疫措施。
日期：2021-06-15
台北市副市長黃珊珊今天在臉書發文表示，在手機上看到衛福部長陳時中的未接來電，但是「接了會怎如何…有用嗎?」，一則發文再次讓中央地方不同調的爭議浮現。下午，陳時中對此貼文也做出回應，他表示，稍早有回電給黃珊珊，並沒有什麼特別的問題，仍需望中央地方兩者要相互合作；黃珊珊在北市府的防疫記者會上，不同於在臉書貼文的炮聲隆隆，態度反而轉趨低調地表示，與陳時中溝通順暢，相信他會不分彼此，但北市府對於疫苗態度是「以數量決定開放對象」，中央卻是「先決定開放對象再決定數量」，以致讓地方政府招來質疑，希望接下來疫苗分配，中央先讓地方知道可分配數量。
日期：2021-06-14
中央流行疫情指揮中心今（14）日公布國內新增185例COVID-19確定病例，均為本土個案；另確診個案中新增15例死亡。
日期：2021-06-14
近日有網友在臉書FB以自製圖文方式散布「政府讓人民施打未受認證且保護力低之國產疫苗」、「國產疫苗的中和抗體效價比國外疫苗差」、「國產疫苗為什麼不向國際提出緊急授權」，中央流行疫情指揮中心(下稱指揮中心)今（13）日嚴正澄清表示，目前國產疫苗臨床試驗尚在進行中，最終結果須等廠商提出EUA 申請，經專家會議審查疫苗的製程管控、藥毒理試驗及臨床試驗結果，在緊急公衛的需求下，確認疫苗使用效益大於風險，才會核准緊急授權使用。
日期：2021-06-13
中央流行疫情指揮中心今(13)日公布國內新增175例COVID-19確定病例，分別為174例本土及1例境外移入；另確診個案中新增26例死亡。這是在5月15日182例本土確診後，睽違近一個月，首度本土新增確診數跌破200例。陳時中也鬆口，疫情新增案例數有漸漸減少，但國人仍不可放鬆。
日期：2021-06-13
中央流行疫情指揮中心昨（12）日表示，有關日本提供之124萬劑AZ疫苗，自6月12日起，分階段陸續配送至各地方政府衛生局或指定醫療院所。雙北市這波疫情爆發的「重災區」，台北市長柯文哲日前表示，高雄市提前知道獲配疫苗的數量，且獲取的劑量也高於台北市，他大酸這是「疫苗內線交易」。對此，指揮中心公布「各縣市配發數量」，也強調，除了日本的AZ疫苗外，也有額外配發莫德納疫苗，台北拿到最多1.6萬劑量，新北其次9800劑。
日期：2021-06-13
日本捐贈給台灣的124萬劑AZ疫苗，將於下週二（15日）開打，中央流行疫情指揮中心今（12）日除了宣布將放寬部分群族施打AZ疫苗，另外也針對國人對AZ疫苗副作用的疑慮做說明。
日期：2021-06-12
台灣今（12）日本土確診案例新增250例、死亡個案26例，針對疫苗，中央流行疫情指揮中心宣布即日起，首批莫德納疫苗開放給尚未接種第一劑疫苗的第一類醫事及非醫事人員接種，另外日本124萬劑的AZ疫苗的施打對象，也將有所放寬。另外，對於昨日首例AZ疫苗施打後死亡案例，發言人莊人祥表示，經法醫研究所協助後發現，該名患者是因急性心肌梗塞而死亡。
日期：2021-06-12
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