行政院周四(12/11)照例召開行政院院會，但院長卓榮泰此次未主持院會，改由副院長鄭麗君主持。此外，卓揆於周一公開行程也曾臨時取消，引發媒體好奇與追問緣由，以及此狀況是否為憲政史上首例。行政院發言人李慧芝在院會後記者會上多次強調，卓揆因「另有要公」而未出席院會，也未主持晨會；她補充前閣揆毛治國也曾請過假，「行政院會議議事規則」有代理機制，無需「多做揣測」。然毛治國當年是在內閣總辭後才開始請假，並由時任副閣揆張善政代理。不過就在行政院稍早通知卓揆周四下午的兩個公開行程也取消後，李慧芝才在會後向媒體補充卓揆因沙啞，僅聽取不需要說話的報告。
日期：2025-12-11
藍白主導立法院三修「財劃法」、8度否決行政院所提覆議，並批評行政院不執行「財劃法」是把自己當皇帝。行政院長卓榮泰周二（12/9）受訪回應，只要立法院好好審議總預算、「強化防衛特別條例」與特別預算，其他都可坐下來談，「行政院無所不能談」。卓揆強調，政府為的就是讓人民能得到照顧、國家能持續發展、主權能受到保障、安全能勇敢來捍衛，就是這樣、如此而已，沒有其他的要求。談到立法院與行政院間的僵局，卓揆在致詞時向在做商界領袖們譬喻，若董事會或股東會通過各種規定，違反「公司法」、「證交法」、「商業會計法」等等，「各位董事長、負責人該如何執行、會不會執行？還是會尋求救濟的方式？」
日期：2025-12-09
藍白聯手於周五（12/5）第八度挾人數優勢，封殺行政院所提覆議案，這次否決的覆議案也是與藍白短期內三度修正的《財政收支劃分法》有關。行政院長卓榮泰周五受訪坦言，從立法院拒絕讓行政院前往報告，就執意表決，「大概大家都知道結果會是如此」。他表示「不要以為把國人的眼睛、耳朵蒙起來，埋在沙子裡，大家就會願意成為一隻鴕鳥」。卓揆也直言，對於這種不經正常的議事程序、違反議事倫理的任何決議，「行政院沒有必須執行的壓力」。
日期：2025-12-05
在台中非洲豬瘟疫情拆彈後，行政院長卓榮泰周四(12/4)在院會拍板禁用廚餘養豬方向，在全國轉型飼料養豬的最後期限2026年12月31日前，由農業部透過飼料補助、餵飼設備補助及必要技術支援等，強化業者飼養管理能力及輔導業者轉型。對於禁用廚餘養豬後，全台每天產生約2105噸廚餘該如何去化？卓揆指示環境部擬定行動計畫，中長期朝堆肥化、能源化或黑水虻等再利用方式推動，並督導及協助設施量能不足的地方政府，加速推動增設生質能源、高效堆肥、黑水虻等廚餘再利用設施。農業部說明，養豬場轉型期間若要續用廚餘，須獲地方同意，完成蒸煮溫度及影像監視系統建置、確保運輸車輛裝設 GPS，經檢查合格後，才能在2026年1月1日起使用事業廚餘、動物性廢渣及畜禽屠宰下腳料，但基於防疫風險，家戶廚餘仍全面禁用。
日期：2025-12-04
美國總統川普簽署《台灣保證落實法案》，行政院長卓榮泰周三（12/3）接見北美多個台灣僑胞團體時指出，該法案不僅是基於地緣政治及中國軍事野心的考量，他也感謝海外僑胞私底下做很多遊說工作，尤其是與美國國會議員的溝通。卓揆也提及當前立法院諸多亂象，許多重要法案躺在立法院無法通過，如總預算案、行政院版「財劃法」、「強化防衛特別條例」，還有立法院主導「國籍法」、停砍年金案、不在籍投票等修法。他盼能站在國家一體、以人民為念，讓國會停止妨礙國家主權、財政與國安的作為。對於立法院要求總統賴清德國情報告且「即問即答」，卓揆表示，憲法規定是「可以去」但非「必須去」，且大法官解釋已指「即問即答」是違憲的。他表示，若要像他到立院那樣被（國民黨團總召傅崐萁）敲桌子、大聲咆哮，「那我來就好了，不用總統，要大聲回答我來就好了。」
日期：2025-12-03
行政院長卓榮泰周四(11/27)於院會拍板財政部報告之「暖心減負擔－所得稅及貨物稅惠民措施」，多項減稅措施包含調高（115年）2026年度免(扣)額及稅率級距，減輕民眾負擔。若是以單身租屋自住者來計算，明年報稅時，年所得64.4萬元以下者即可免繳所得稅，比起前一年度提高了1.8萬元；如果是租屋自住且有2名6歲以下子女的4口之家，年所得168.5萬元以下也可免繳稅。經此次調整，財政部估將有696萬戶受益，總減稅利益達144億元。此項措施已獲立法院財政委員會審查通過，待完成立法程序，2026年免稅額及扣除額等惠民措施，將於明年5月報稅時適用。
日期：2025-11-27
為因應中國目標2027年武統的威脅，總統賴清德宣布規模1.25兆元的「守護民主台灣國安行動方案」。行政院長卓榮泰於周四（11/27）行政院會中，通過國防部研擬之「強化防衛韌性及不對稱戰力計畫採購特別條例」（強化防衛特別條例）草案，將送立法院審議。卓揆坦言在賴總統周三說明提出此特別條例之理由後，仍有部分悖離事實的言論不斷出現。他向國人及國內各政黨喊話「沒有國哪有家，沒有國哪有黨」，並呼籲此時此刻應拋棄政黨成見，以國、以家、以人民為念。
日期：2025-11-27
10月22日一早農業部緊急召開記者會，部長陳駿季面色凝重地宣布，10月21日下午6時6分，獸醫所檢驗的台中梧棲某畜牧場的病毒株檢體結果，呈現「非洲豬瘟病毒陽性」，震撼全國。這沉重的宣告，標記出台灣史上首個非洲豬瘟案例。經過全國17天風風火火的防疫後，11月6日中午起，非洲豬瘟中央災害應變中心正式解除國內豬隻禁運禁宰令，象徵台灣首次非洲豬瘟疫情危機成功「拆彈」。《今周刊》採訪各階段中的其中四位關鍵角色：督導防疫業務的行政院政委陳時中、指揮應變中心的農業部長陳駿季，還有防守第一線檢驗業務的獸醫所所長鄧明中，與第一時間驗出陽性的獸醫所副研究員黃有良，以還原這17天拆彈過程。
日期：2025-11-26
美國華盛頓郵報25日刊登賴清德總統的投書，賴總統在文中表達對美國總統川普的感謝，稱國際社會因川普政府追求「以實力謀和平」而變得更加安全，並表示，台灣面對來自北京的壓力，他將大幅增加台灣的國防預算，也會加速打造「台灣之盾」（T-Dome）防空系統。
日期：2025-11-26
藍白在立法院短期內三度修正《財政收支劃分法》，藍白仍不排除將行政院版草案暫緩列案或退回。行政院長卓榮泰周二（11/25）直言，這正好印證「匆匆忙忙」，結果是讓政府要舉債、負擔更多債務，「匆匆忙忙」的是讓政府破產，更嚴重的是竟然不允許行政院「從從容容」和地方溝通。行政院可對立法院「財劃法」提出覆議的期限落於周四（11/27），卓揆強調仍會利用本周時間再與地方政府做溝通。但他直言朝野黨團上周談妥不處理後續公式錯誤問題，會等行政院本周提出後再討論，結果是在野黨團「自己撕毀了承諾」。
日期：2025-11-25
